第一集；（异形之卵复活）
故事讲的是一颗外星陨石坠落地球，而陨石内居然有沉睡的活体，在未知的外生物降临，人类将他视为样本，并且年复一年的观察和研究，且给他取名为异形之卵。谁知，就在二十年后的今天，异形之卵突然复活，眼看着一场浩劫降临，这时，一位来自完美之星的奥特战士到来，这才适时的阻止悲剧的发生。（剧情慢热，简短解说，请大家慢慢欣赏）
{主角}塞斯杰罗奥特曼，出生；完美之星，被誉为宇宙间最年轻的战士之一，属于行者体系，数百年前因得罪黑暗使者，成为势不两立的仇家，最终被其打败并封印。
{人间体}星云，塞斯杰罗奥特曼的人间体，出生于天鹅座，是目前第一位加入地下基地的外星人类。
{反派}黑暗使者落瓦斯，塞斯杰罗的死对头，宇宙间最歹毒邪恶的象征，能驾驭虫洞穿俊在各大宇宙星系，手里掌握着暗黑星辰的生杀大权，就连完美之星也对她惧怕三分。
{现实}天外陨石在现实中也是笔可观的财富，不少人为了他翻山越岭的去寻找，而这集的故事也是如此，科学家为了能经过天外陨石来探测宇宙外的生命，抱着能以提高科技为人类造福的心态，铤而走险的去尝试前所未有的研究工程。
{后续}异形兽虽然被黑暗使者带走，但故事并没有完，在后续会再出现异形兽，并且再次出场就有奥特曼受的，因为在黑暗使者饲养下，让异形兽二度进化，变成究极超合兽、裂异加多曼（撕裂的异形，乃上古超恐怖怪兽）。
第二集；（死亡之花）
一朵来自天鹅座星系的奇花灵兽{花后莫斯塔}，被黑暗使者用黑暗物质控制，将他带到地球进行入侵计划。然而，计划进行的并不是很顺利，刚开始行动就被星云察觉{塞斯杰罗的人间体}，但他却没能阻止花后的毁坏，反而使得形势提前恶化。最后，经过一番苦战，塞斯杰罗利用净化蓝宝石，将花后莫斯塔拯救。从此之后，花后莫斯塔就时刻的待在星云的身边，甚至在他遇到困难时也会出面相救。
{奉献}花后莫斯塔，曾为另一位奥特女战士，使用自己的花粉制作出一件铠甲，名叫黄金续光铠甲，换上这套铠甲不但能够再次能量加满，且可以延长作战时间，对奥特战士而言，这是不可多得的后盾，而他为了感谢塞斯杰罗，并将这件铠甲赠送与他。
第三集；（不明发光体）
一颗不明的发光飞行物，躲过了卫星的摄像，就连雷达也无法扫描到他，地下基地为此搜查十分困难。随着种种事件发生，不明物体终于浮出水面，原来是巨嘴不死鸟贾休斯在作怪，因他的身体属活金属结构，能释放一种干扰电波，就连最先进的科技都无法准确找到他。
{后续}巨嘴不死鸟贾休斯被神秘圆盘救走，本集故事算是画上句号，可是神秘圆盘究竟是好是坏，为什么要救他，这将会在第三个剧场版《电磁人》中告知。
第四集；（外星来客）
亚托斯星人声言寻找自己失散多年的弟弟来到地球，那曾想他却是另有阴谋，就在当天夜里手刃自己的亲弟弟。失去超能力和记忆的弟弟，在奄奄一息之际，说出了事情的原因，得知亚托斯早已入了魔，正在用魔物修炼自身。得知这一消息，非但连昔日同为战士的塞斯杰罗不能接受，就连受到欺骗的人类也不能宽容，直接合力将他击败。
{现实}为了个人的利益背信弃义、食言而肥，最终闹的兄弟朋友之间反目成仇，诸类事情在现实中可说是多不胜数，而故事中的亚托司正是如此，但他最大的错误就是，给他的家族带上耻辱的帽子。
{尽请期待}亚托司的父亲也会出现，并且帮助塞斯杰罗，打败了邪恶的外形入侵者。
第五集；（城市的污染）
兰市的水渠河道一夜之间恶臭熏天，到处都是漂浮生物，连鱼虾和动物都为之感染变异。当地下基地进行大面积搜查时，不但找到了污染的源点，并且隐约察觉其中的隐情。最终。当怪兽被解决后，事情也水落石出，原来，这一切都是因为疏忽大意才造成的后果。
{现实}怪兽制造了这场灾难性的污染，一看就不像话，因为怪兽是幻想出来的，而污染才是现实中存在的。这篇故事依照城市污染来写照，提醒大家一定要爱护环境，保护自然，只要我们共同携手，地球就能变得更加美丽、健康。
第六集；（冒险旅游团）
穆楠和杜晓丽两位女队员，结实一组冒险队，且趁着假期与他们一起去探险，没曾想到，数人误打误撞将一头火山怪兽从封印中放出来。事后，总基地损失惨重，将两人严厉的惩罚。那知，火山怪兽的到来居然是有人故意留在地球。
{异能者}卡尔亚，是外星基地派来的异能者，专门封印火山怪兽来到地球，擅长异能法阵，更精通许多外星科技，怪兽被消灭后，他被留在地下基地。
{狩猎者}凯亚人，他们是宇宙间的狩猎者，擅长狩猎和制服怪兽，当年将火山怪兽带到地球的就是他们。
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