1990-91赛季结束后，马龙成为自由球员，密尔沃基雄鹿队将其签下。
1991-92赛季，雄鹿队将马龙放到了首发阵容，最终他在82场常规赛中场均交出15.6分和9.1个篮板的成绩单。马龙该赛的场均得分位列队内第二，场均篮板队内第一，单赛季82场常规赛马龙有54场是队内篮板王。该赛季，马龙有2次单场拿下30分，1992年3月27日雄鹿和超音速的比赛中，马龙单场更是抓下19个篮板。处于重建期的雄鹿取得31胜51负的战绩，和夏洛特黄蜂队并列位居中部赛区倒数第一。
1992-93赛季，马龙因为背伤缺席了大部分比赛。直到1993年3月27日他才迎来新赛季的首场比赛，最终马龙该赛季只打了11场比赛，场均得到4.5分和4.4个篮板。4月12日与热火队的比赛中，马龙打出个人赛季最好的一场比赛，这场比赛他打了18分钟，拿下12分和9个篮板。尽管球队拥有不少天赋实力不错的球员，但是这个赛季雄鹿队依然在泥潭中挣扎，他们取得28胜54负的战绩，在中部赛区垫底。
1993年的八月份76人队签下马龙，让他负责带一下新秀肖恩·布拉德利。
1993-94赛季是马龙在NBA的第18个赛季，也是他进入职业篮球的第20个赛季。该赛季马龙也是当时联盟唯一的一位仍在NBA效力的前ABA球员。这个赛季，马龙代表76人队打了55场比赛，以替补身份出战的他场均可以得到5.3分和4.1个篮板。赛季末，马龙的职业生涯总得分达到了27360分，当时位居联盟历史个人总得分榜的第三位。而在总出场次数方面则以1312场位列第三，总篮板（16166）位居第五，其中进攻篮板（6711）位居联盟第一位，罚球命中数（8509）同样位居联盟历史第一，制造罚球总数（11058）则位居联盟第二。
1994年，马龙以自由球员身份和马刺队签约，这也是他职业生涯的最后一个赛季。1994-95赛季，马龙担任大卫·罗宾逊的替补。该赛季和夏洛特黄蜂队的一场比赛中，马龙命中压哨三分，这也是他职业生涯命中的第八个三分球。马龙为马刺队打了17场比赛，这17场比赛都是在1994年的11月份和12月份。马龙便因右小腿跟腱撕裂，被放入了伤病名单。1月15日，马龙接受了手术。赛季结束后，马龙宣布退役。
1996年，马龙当之无愧当选了NBA50大巨星，2001年入选了篮球名人堂。
摩西·马龙在21年的职业篮球生涯中共出征1455场，其中NBA1329场，排在罗伯特·帕里什和贾巴尔之后。在NBA19个赛季中共得到27409分，位列第七。他以8531个罚球命中个数排名NBA第一，11090次的罚球出手数也仅次于威尔特·张伯伦。篮板球总数为16212个，排名第五。其中他抢的前场篮板球（进攻篮板球）有6731个，比排名第二的选手整整高出2000多个，这是NBA各项技术指标中第1名和第2名之间差距第二大的一个（差距第一大的是助攻，第一名斯托克顿高出第二名基德4000多个）。此外他还保持着另外2项NBA抢进攻篮板球的纪录：一个赛季587个前场篮板球和一场比赛21个前场篮板球。其同时，他还是史上出战第三多者（1329场），出战时间第六多者（45071分钟）和总出手次数的第十把交椅（19225次）。1973-74赛季起，联盟开始将进攻篮板和防守篮板分开计算，马龙不但以惊人的6731个进攻篮板问鼎史上桂冠，而其9481个防守篮板的数字也仅次于超级长命的“酋长”罗伯特·帕里什。
摩西·马龙在21年的篮球生涯中，他得分达到29580分，列贾巴尔，卡尔·马龙，迈克尔·乔丹，科比，威尔特·张伯伦和朱利叶斯·欧文之后，居史上第七。揽下17834个篮板，仅次于威尔特·张伯伦，比尔·拉塞尔，居史上第三。此外，他的罚球命中数（9018）和罚球出手数（11864）都是史上最二，仅次于卡尔·马龙，出战场次（1455场）居史上第五，出战时间（49444分钟）居史上第三，总命中数（10277）和总出手数（20750）则居第九。马龙职业生涯中有11个赛季场均得分超过20。马龙另保持着一项令人瞠目的纪录：他连续1207场比赛没有被罚下，这个数字无人可及。他还是联盟单季进攻篮板，单场进攻篮板纪录（21个）的保持者——后一项纪录的缔造时间是1977年2月2日，对手西雅图超音速队。
卫冕冠军快船队的阵容是：贾巴尔（主力中锋），拉里·斯密斯（主力大前锋中锋），拉里·伯德（主力小前锋大前锋）、李耀辉（主力得分后卫）、埃尔文·约翰逊（主力控球后卫）、阿奇博尔德（替补控球后卫）、迈克尔·库帕（替补得分后卫小前锋）、维尼·约翰逊（替补得分后卫）、比尔·兰比尔（替补中锋）、比尔·沃尔顿（替补中锋）、拉里·南斯（替补大前锋中锋）、乔-布莱恩特（替补大前锋）、斯文·纳特（替补大前锋中锋）。
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